Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSPNQ14714 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSPNQ14714 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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