Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBFBQ13951 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBFBQ13951 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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