Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H3Q13889 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms