Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H2Q13888 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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