Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NCOA4Q13772 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms