Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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