Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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