Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3B2Q13367 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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