Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CDK16-222ENST00000523699 675 ntTSL 519.16■□□□□ 0.668e-7■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-8■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-12■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.068e-7■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-12■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.298e-7■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 BBS4-202ENST00000395205 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.618e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZNF480-206ENST00000598016 559 ntTSL 410.71□□□□□ -0.698e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-12■■□□□ 12
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PABPC4Q13310 VPS4B-201ENST00000238497 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.818e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MOV10-206ENST00000468624 4689 ntTSL 59.89□□□□□ -0.831e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 C10orf128-208ENST00000488276 490 ntTSL 39.48□□□□□ -0.891e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.958e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.028e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.068e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.068e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PPP1R12A-215ENST00000550351 738 ntTSL 26.81□□□□□ -1.328e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PPP1R12A-222ENST00000634739 560 ntTSL 26.79□□□□□ -1.328e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PPP1R12A-214ENST00000550299 683 ntTSL 56.73□□□□□ -1.338e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.348e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZNF480-203ENST00000468240 2527 ntTSL 26.56□□□□□ -1.368e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.418e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PPP1R12A-205ENST00000546762 1257 ntTSL 55.96□□□□□ -1.468e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.461e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 IPO11-212ENST00000511713 1865 ntTSL 35.55□□□□□ -1.521e-6■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PPP1R12A-217ENST00000550903 959 ntTSL 55.46□□□□□ -1.548e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.638e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 PPP1R12A-207ENST00000547253 676 ntTSL 24.4□□□□□ -1.718e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 TBCA-204ENST00000517881 359 ntTSL 23.61□□□□□ -1.831e-12■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RPL30-211ENST00000521726 1129 ntTSL 317.95■□□□□ 0.461e-39■■□□□ 12
PABPC4Q13310 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-39■■□□□ 12
PABPC4Q13310 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CAPN1-220ENST00000530567 1415 ntTSL 225.03■■□□□ 1.67e-7■■□□□ 12
PABPC4Q13310 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.987e-7■■□□□ 12
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