Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms