Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TRAF2Q12933 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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TRAF2Q12933 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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