Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFCP2Q12800 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFCP2Q12800 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms