Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms