Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms