Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms