Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EMX2Q04743 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms