Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms