Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms