Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms