Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms