Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2C1P98194 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms