Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms