Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms