Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms