Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms