Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB38P57729 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms