Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms