Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GEMP55040 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEMP55040 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEMP55040 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEMP55040 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms