Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA4P54764 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms