Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms