Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RANGAP1P46060 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms