Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAGEA3P43357 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms