Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms