Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms