Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD13P35453 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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HOXD13P35453 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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HOXD13P35453 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
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