Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-FP30511 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms