Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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