Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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