Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCD3P28288 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCD3P28288 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms