Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms