Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNA2P20248 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms