Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DPA1P20036 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DPA1P20036 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms