Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DESP17661 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DESP17661 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DESP17661 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DESP17661 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms