Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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