Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BMP4P12644 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BMP4P12644 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BMP4P12644 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BMP4P12644 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms