Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA4P06727 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA4P06727 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA4P06727 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA4P06727 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms