Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SPTA1P02549 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTA1P02549 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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