Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLIN3O60664 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms