Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALUO43852 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALUO43852 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALUO43852 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALUO43852 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALUO43852 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALUO43852 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms