Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCAO15360 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCAO15360 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCAO15360 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCAO15360 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCAO15360 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCAO15360 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCAO15360 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCAO15360 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms